Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms