Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pagr1aQ99L02 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms