Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms