Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms