Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms