Protein–RNA interactions for Protein: Q99K99

Uncharacterized protein C4orf19 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99K99 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99K99 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99K99 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99K99 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99K99 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99K99 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99K99 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99K99 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99K99 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99K99 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99K99 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99K99 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99K99 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99K99 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99K99 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99K99 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99K99 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99K99 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99K99 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99K99 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99K99 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99K99 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99K99 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99K99 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99K99 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99K99 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99K99 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99K99 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99K99 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99K99 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99K99 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99K99 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99K99 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99K99 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99K99 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99K99 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99K99 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99K99 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99K99 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99K99 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99K99 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99K99 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99K99 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99K99 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99K99 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99K99 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99K99 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99K99 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99K99 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99K99 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99K99 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99K99 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99K99 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99K99 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99K99 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99K99 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99K99 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q99K99 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99K99 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99K99 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99K99 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99K99 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99K99 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99K99 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99K99 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99K99 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99K99 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99K99 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99K99 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99K99 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99K99 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99K99 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99K99 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99K99 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99K99 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99K99 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99K99 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99K99 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99K99 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99K99 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99K99 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99K99 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99K99 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99K99 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99K99 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99K99 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99K99 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99K99 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99K99 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99K99 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99K99 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99K99 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99K99 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99K99 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99K99 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99K99 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99K99 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99K99 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99K99 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99K99 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms