Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxp3Q99JB6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxp3Q99JB6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxp3Q99JB6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxp3Q99JB6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxp3Q99JB6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxp3Q99JB6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxp3Q99JB6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxp3Q99JB6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Foxp3Q99JB6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Foxp3Q99JB6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxp3Q99JB6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxp3Q99JB6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxp3Q99JB6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxp3Q99JB6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxp3Q99JB6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxp3Q99JB6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxp3Q99JB6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxp3Q99JB6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxp3Q99JB6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxp3Q99JB6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxp3Q99JB6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxp3Q99JB6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxp3Q99JB6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxp3Q99JB6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxp3Q99JB6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxp3Q99JB6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms