Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan1Q99J59 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan1Q99J59 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan1Q99J59 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan1Q99J59 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan1Q99J59 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan1Q99J59 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan1Q99J59 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan1Q99J59 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan1Q99J59 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan1Q99J59 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan1Q99J59 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan1Q99J59 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan1Q99J59 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan1Q99J59 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan1Q99J59 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan1Q99J59 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan1Q99J59 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms