Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctu1Q99J10 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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