Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms