Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SptssbQ925E8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms