Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Spdl1Q923A2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spdl1Q923A2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Spdl1Q923A2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spdl1Q923A2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spdl1Q923A2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spdl1Q923A2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spdl1Q923A2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms