Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b3Q921M3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms