Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TardbpQ921F2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms