Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin3bQ91ZU9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin3bQ91ZU9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin3bQ91ZU9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin3bQ91ZU9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin3bQ91ZU9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin3bQ91ZU9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin3bQ91ZU9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin3bQ91ZU9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin3bQ91ZU9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin3bQ91ZU9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin3bQ91ZU9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin3bQ91ZU9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin3bQ91ZU9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin3bQ91ZU9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin3bQ91ZU9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin3bQ91ZU9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin3bQ91ZU9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin3bQ91ZU9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin3bQ91ZU9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms