Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms