Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna2Q91X60 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms