Protein–RNA interactions for Protein: Q91WS2

Nlrp6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp6Q91WS2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp6Q91WS2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlrp6Q91WS2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms