Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd3Q91WC0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms