Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Klc3Q91W40 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms