Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA1

Slc44a4, Choline transporter-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a4Q91VA1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a4Q91VA1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a4Q91VA1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a4Q91VA1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a4Q91VA1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a4Q91VA1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a4Q91VA1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a4Q91VA1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a4Q91VA1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a4Q91VA1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a4Q91VA1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a4Q91VA1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc44a4Q91VA1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc44a4Q91VA1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc44a4Q91VA1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a4Q91VA1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc44a4Q91VA1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms