Protein–RNA interactions for Protein: Q91V98

Cd248, Endosialin, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd248Q91V98 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cd248Q91V98 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd248Q91V98 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms