Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc8Q8VD72 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms