Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sgip1Q8VD37 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgip1Q8VD37 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms