Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms