Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
0610009B22RikQ8R3W2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
0610009B22RikQ8R3W2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
0610009B22RikQ8R3W2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
0610009B22RikQ8R3W2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
0610009B22RikQ8R3W2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
0610009B22RikQ8R3W2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
0610009B22RikQ8R3W2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms