Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3F9

Tut1, Speckle targeted PIP5K1A-regulated poly(A) polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tut1Q8R3F9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tut1Q8R3F9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tut1Q8R3F9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms