Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnaaf4Q8R368 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnaaf4Q8R368 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaaf4Q8R368 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaaf4Q8R368 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaaf4Q8R368 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaaf4Q8R368 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaaf4Q8R368 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaaf4Q8R368 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaaf4Q8R368 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaaf4Q8R368 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaaf4Q8R368 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaaf4Q8R368 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaaf4Q8R368 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaaf4Q8R368 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms