Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11fip5Q8R361 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip5Q8R361 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms