Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Vmn1r200Q8R281 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Vmn1r200Q8R281 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r200Q8R281 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Vmn1r200Q8R281 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Vmn1r200Q8R281 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Vmn1r200Q8R281 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Vmn1r200Q8R281 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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Vmn1r200Q8R281 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Vmn1r200Q8R281 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Vmn1r200Q8R281 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Vmn1r200Q8R281 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
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Vmn1r200Q8R281 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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