Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssh3Q8K330 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms