Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms