Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc12Q8K2L8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms