Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spire2Q8K1S6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms