Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms