Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FgbQ8K0E8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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