Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbm17Q8JZX4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rbm17Q8JZX4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbm17Q8JZX4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbm17Q8JZX4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbm17Q8JZX4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms