Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms