Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CopaQ8CIE6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CopaQ8CIE6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CopaQ8CIE6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CopaQ8CIE6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CopaQ8CIE6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CopaQ8CIE6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CopaQ8CIE6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CopaQ8CIE6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CopaQ8CIE6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CopaQ8CIE6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CopaQ8CIE6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CopaQ8CIE6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CopaQ8CIE6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms