Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI43

Myl6b, Myosin light chain 6B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl6bQ8CI43 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myl6bQ8CI43 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myl6bQ8CI43 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myl6bQ8CI43 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Myl6bQ8CI43 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myl6bQ8CI43 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myl6bQ8CI43 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myl6bQ8CI43 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myl6bQ8CI43 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myl6bQ8CI43 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myl6bQ8CI43 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myl6bQ8CI43 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myl6bQ8CI43 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myl6bQ8CI43 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myl6bQ8CI43 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myl6bQ8CI43 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myl6bQ8CI43 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myl6bQ8CI43 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myl6bQ8CI43 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myl6bQ8CI43 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myl6bQ8CI43 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myl6bQ8CI43 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms