Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH77

Nav1, Neuron navigator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav1Q8CH77 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nav1Q8CH77 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nav1Q8CH77 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Nav1Q8CH77 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nav1Q8CH77 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nav1Q8CH77 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nav1Q8CH77 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nav1Q8CH77 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nav1Q8CH77 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nav1Q8CH77 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nav1Q8CH77 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nav1Q8CH77 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nav1Q8CH77 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nav1Q8CH77 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nav1Q8CH77 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms