Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH20

Cypt1, Cysteine-rich perinuclear theca protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cypt1Q8CH20 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cypt1Q8CH20 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cypt1Q8CH20 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cypt1Q8CH20 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cypt1Q8CH20 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cypt1Q8CH20 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cypt1Q8CH20 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cypt1Q8CH20 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cypt1Q8CH20 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cypt1Q8CH20 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cypt1Q8CH20 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cypt1Q8CH20 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cypt1Q8CH20 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cypt1Q8CH20 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cypt1Q8CH20 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cypt1Q8CH20 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cypt1Q8CH20 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cypt1Q8CH20 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cypt1Q8CH20 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cypt1Q8CH20 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms