Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rsph6aQ8CDR2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms