Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms