Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms