Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY8

Dctn4, Dynactin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn4Q8CBY8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn4Q8CBY8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms