Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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