Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp20Q8C6M1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp20Q8C6M1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp20Q8C6M1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp20Q8C6M1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp20Q8C6M1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp20Q8C6M1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
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Usp20Q8C6M1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
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Usp20Q8C6M1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Usp20Q8C6M1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Usp20Q8C6M1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp20Q8C6M1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp20Q8C6M1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp20Q8C6M1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp20Q8C6M1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp20Q8C6M1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp20Q8C6M1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp20Q8C6M1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp20Q8C6M1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp20Q8C6M1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp20Q8C6M1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp20Q8C6M1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp20Q8C6M1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp20Q8C6M1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp20Q8C6M1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp20Q8C6M1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp20Q8C6M1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp20Q8C6M1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp20Q8C6M1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp20Q8C6M1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp20Q8C6M1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp20Q8C6M1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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