Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z3

Ssxb2, Synovial sarcoma, X member B2, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb2Q8C5Z3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ssxb2Q8C5Z3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ssxb2Q8C5Z3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ssxb2Q8C5Z3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ssxb2Q8C5Z3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ssxb2Q8C5Z3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb2Q8C5Z3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ssxb2Q8C5Z3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb2Q8C5Z3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb2Q8C5Z3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb2Q8C5Z3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb2Q8C5Z3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb2Q8C5Z3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb2Q8C5Z3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ssxb2Q8C5Z3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ssxb2Q8C5Z3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb2Q8C5Z3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb2Q8C5Z3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ssxb2Q8C5Z3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb2Q8C5Z3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb2Q8C5Z3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb2Q8C5Z3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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