Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y0

4930572O03Rik, RIKEN cDNA 4930572O03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930572O03RikQ8C5Y0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930572O03RikQ8C5Y0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930572O03RikQ8C5Y0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
4930572O03RikQ8C5Y0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930572O03RikQ8C5Y0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930572O03RikQ8C5Y0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930572O03RikQ8C5Y0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930572O03RikQ8C5Y0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930572O03RikQ8C5Y0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930572O03RikQ8C5Y0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930572O03RikQ8C5Y0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930572O03RikQ8C5Y0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930572O03RikQ8C5Y0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930572O03RikQ8C5Y0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930572O03RikQ8C5Y0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930572O03RikQ8C5Y0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms